MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 55991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015574	TTA	2	6	236967	236972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015574	T	8	8	236981	236988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015574	AAC	2	6	236990	236995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015574	ATT	2	6	237031	237036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015574	TACTAT	2	12	237048	237059	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5006	NC_015574	TTC	2	6	237086	237091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986445
5007	NC_015574	TGC	2	6	237157	237162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986445
5008	NC_015574	CAG	2	6	237168	237173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986445
5009	NC_015574	ATT	2	6	237233	237238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986445
5010	NC_015574	GAA	2	6	237298	237303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986445
5011	NC_015574	T	6	6	237316	237321	0 %	100 %	0 %	0 %	333986445
5012	NC_015574	T	6	6	237328	237333	0 %	100 %	0 %	0 %	333986445
5013	NC_015574	T	6	6	237455	237460	0 %	100 %	0 %	0 %	333986445
5014	NC_015574	TTTC	2	8	237483	237490	0 %	75 %	0 %	25 %	333986445
5015	NC_015574	CTC	2	6	237507	237512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986445
5016	NC_015574	GCA	2	6	237566	237571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986445
5017	NC_015574	TACT	2	8	237582	237589	25 %	50 %	0 %	25 %	333986445
5018	NC_015574	GAA	2	6	237685	237690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986445
5019	NC_015574	CCT	2	6	237698	237703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986445
5020	NC_015574	CAT	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986446
5021	NC_015574	ACA	3	9	237907	237915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
5022	NC_015574	T	6	6	237939	237944	0 %	100 %	0 %	0 %	333986446
5023	NC_015574	CTA	2	6	237965	237970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986446
5024	NC_015574	CCA	2	6	238075	238080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986446
5025	NC_015574	T	6	6	238110	238115	0 %	100 %	0 %	0 %	333986446
5026	NC_015574	ACC	2	6	238186	238191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986446
5027	NC_015574	CTT	2	6	238199	238204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986446
5028	NC_015574	TGT	2	6	238241	238246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986446
5029	NC_015574	TCAAGA	2	12	238249	238260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333986446
5030	NC_015574	TC	3	6	238278	238283	0 %	50 %	0 %	50 %	333986446
5031	NC_015574	TTC	2	6	238341	238346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986446
5032	NC_015574	AAC	2	6	238401	238406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
5033	NC_015574	T	6	6	238439	238444	0 %	100 %	0 %	0 %	333986446
5034	NC_015574	T	6	6	238553	238558	0 %	100 %	0 %	0 %	333986446
5035	NC_015574	TGA	2	6	238562	238567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986446
5036	NC_015574	CTG	2	6	238601	238606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986446
5037	NC_015574	AAC	2	6	238647	238652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
5038	NC_015574	TAT	2	6	238823	238828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015574	TGT	2	6	238942	238947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015574	T	6	6	238999	239004	0 %	100 %	0 %	0 %	333986447
5041	NC_015574	GAA	2	6	239030	239035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986447
5042	NC_015574	T	6	6	239047	239052	0 %	100 %	0 %	0 %	333986447
5043	NC_015574	TGC	2	6	239119	239124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986447
5044	NC_015574	TGG	2	6	239154	239159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986447
5045	NC_015574	GCA	2	6	239306	239311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986447
5046	NC_015574	TAT	2	6	239467	239472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986447
5047	NC_015574	CAA	2	6	239499	239504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986447
5048	NC_015574	T	7	7	239512	239518	0 %	100 %	0 %	0 %	333986447
5049	NC_015574	TTA	2	6	239700	239705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986447
5050	NC_015574	TTAT	2	8	239780	239787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015574	TAAA	2	8	239794	239801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015574	T	8	8	239821	239828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015574	TTA	2	6	239848	239853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015574	ATTT	2	8	239871	239878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015574	A	8	8	239914	239921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015574	TTTAA	2	10	239947	239956	40 %	60 %	0 %	0 %	333986448
5057	NC_015574	T	7	7	239974	239980	0 %	100 %	0 %	0 %	333986448
5058	NC_015574	GCT	2	6	240002	240007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
5059	NC_015574	ACC	2	6	240040	240045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986448
5060	NC_015574	TAT	2	6	240049	240054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986448
5061	NC_015574	TGC	2	6	240061	240066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
5062	NC_015574	GCA	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986448
5063	NC_015574	TGTT	2	8	240109	240116	0 %	75 %	25 %	0 %	333986448
5064	NC_015574	GCT	2	6	240134	240139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
5065	NC_015574	CTT	2	6	240144	240149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986448
5066	NC_015574	ATGT	2	8	240191	240198	25 %	50 %	25 %	0 %	333986448
5067	NC_015574	TAC	2	6	240214	240219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986448
5068	NC_015574	G	6	6	240231	240236	0 %	0 %	100 %	0 %	333986448
5069	NC_015574	TGT	2	6	240237	240242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986448
5070	NC_015574	CGT	2	6	240363	240368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
5071	NC_015574	GGTTT	2	10	240605	240614	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015574	A	6	6	240655	240660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015574	A	7	7	240671	240677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015574	T	7	7	240685	240691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015574	GTT	2	6	240723	240728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986449
5076	NC_015574	ATG	2	6	240765	240770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986449
5077	NC_015574	TG	3	6	240821	240826	0 %	50 %	50 %	0 %	333986449
5078	NC_015574	GTA	2	6	240911	240916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986449
5079	NC_015574	GGT	2	6	240959	240964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986449
5080	NC_015574	GGC	2	6	240977	240982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986449
5081	NC_015574	TTG	2	6	241062	241067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986449
5082	NC_015574	ATT	2	6	241155	241160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015574	AAAT	2	8	241196	241203	75 %	25 %	0 %	0 %	333986450
5084	NC_015574	TG	3	6	241237	241242	0 %	50 %	50 %	0 %	333986450
5085	NC_015574	ATT	2	6	241255	241260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
5086	NC_015574	AAG	2	6	241326	241331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986450
5087	NC_015574	TCT	2	6	241436	241441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986450
5088	NC_015574	TATG	2	8	241485	241492	25 %	50 %	25 %	0 %	333986450
5089	NC_015574	TGGAA	2	10	241495	241504	40 %	20 %	40 %	0 %	333986450
5090	NC_015574	TAG	2	6	241535	241540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
5091	NC_015574	TGA	2	6	241541	241546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
5092	NC_015574	TTG	3	9	241571	241579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986450
5093	NC_015574	GTG	2	6	241649	241654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986450
5094	NC_015574	ATT	2	6	241783	241788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
5095	NC_015574	ACC	2	6	241839	241844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986450
5096	NC_015574	ATT	2	6	241873	241878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
5097	NC_015574	TGA	2	6	241912	241917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
5098	NC_015574	TTA	2	6	241961	241966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
5099	NC_015574	TCC	2	6	241980	241985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986450
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5101	NC_015574	T	6	6	242193	242198	0 %	100 %	0 %	0 %	333986451
5102	NC_015574	CAA	2	6	242226	242231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986451
5103	NC_015574	ATC	2	6	242260	242265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986451
5104	NC_015574	TAT	2	6	242353	242358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986451
5105	NC_015574	TCT	2	6	242403	242408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986451
5106	NC_015574	T	8	8	242490	242497	0 %	100 %	0 %	0 %	333986451
5107	NC_015574	TCTT	2	8	242499	242506	0 %	75 %	0 %	25 %	333986451
5108	NC_015574	CTT	2	6	242519	242524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986451
5109	NC_015574	T	6	6	242537	242542	0 %	100 %	0 %	0 %	333986451
5110	NC_015574	CTA	2	6	242652	242657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986451
5111	NC_015574	TTA	2	6	242682	242687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015574	T	6	6	242696	242701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015574	AAT	2	6	242702	242707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015574	TCTTA	2	10	242712	242721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5115	NC_015574	T	6	6	242723	242728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015574	ATT	2	6	242744	242749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015574	T	9	9	242778	242786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015574	ATT	2	6	242799	242804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015574	CCA	2	6	242829	242834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_015574	A	6	6	242834	242839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015574	A	7	7	242855	242861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015574	A	6	6	242869	242874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015574	AAT	2	6	242892	242897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015574	A	7	7	242901	242907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015574	A	7	7	242916	242922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_015574	T	6	6	242946	242951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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